2024年5月03日 星期五

颜宁等在《科学》发文揭示心肌钙离子通道RyR2长程门控机制的结构基础

北京时间2016年9月22日,清华大学颜宁研究组与加拿大卡尔加里大学(University of Calgary)陈穗荣研究组合作在《科学》(Science)期刊在线发表标题为 “Structural basis for the gating mechanism of the type 2 ryanodine receptor RyR2”(2型Ryanodine受体RyR2门控机制的结构基础)的研究长文,揭示了目前已知分子量最大的离子通道Ryanodine受体RyR2亚型处于关闭和开放两种状态的三维电镜结构,探讨了RyR2的门控机制。

 

RyR是广泛存在于肌肉细胞(包括骨骼肌和心肌)及脑组织中的钙离子释放通道,其功能是在收到上游信号后,将内质网或肌质网中的钙离子迅速释放到细胞质中,从而触发进一步的信号传递,比如导致肌肉收缩等等。在哺乳动物中,RyR有三个亚型,其中RyR1和RyR2分别在骨骼肌和心肌的兴奋-收缩偶联中发挥作用。所谓兴奋-收缩偶联(excitation-contraction coupling, ECC)是指上游的电压门控钙离子通道Cav在收到动作电位刺激活化后激活RyR,从而最终导致肌肉收缩这一生理过程。肌肉收缩的生理重要性不言而喻,因此从分子乃至原子水平理解兴奋-收缩偶联具有重大意义。

 

RyR1与Cav1.1主要在骨骼肌中发挥作用,而心脏中对应的RyR2和Cav1.2尽管序列于骨骼肌同源蛋白相近,但它们的激活方式却存在很大差异。Cav1.1能够与RyR1形成超级复合物,并通过构象变化激活RyR1;而RyR2的激活则主要依靠经Cav1.2涌入的钙离子来实现。此外,RyR2的突变会导致心脏功能紊乱,引发包括儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速、特发性心室颤动、心脏性猝死等在内的疾病。因此,对于心脏中兴奋-收缩偶联过程的研究将有助于人们充分认识其工作机制,并为相关疾病的发生机理提供理论解释,同时也能够为相关的药物开发提供指导。

 

在最新的《科学》论文中,颜宁研究组报道了RyR2处于关闭和开放两种不同状态的近原子分辨率冷冻电镜结构。RyR2蛋白样品纯化自猪心,样品的获取非常不易。不过得益于近年来清华大学冷冻电镜平台的迅猛发展,最终仅利用少量蛋白样品即解析了两个状态下的结构。此前数十年的研究已经积累了大量有关RyR功能调节的数据,很多蛋白、离子及其他小分子都可以结合并影响RyR的功能及通道开关,以细胞质中的钙离子为例:浓度处于微摩(μM)量级的钙离子会激活RyR,而当浓度达到毫摩(mM)量级后钙离子又会反过来抑制RyR。在此次相关研究工作中,她们使用EDTA来锁定RyR2的关闭构象,利用20 μM的钙离子和小分子PCB 95来稳定住开放构象,从而最终获得了分辨率分别为4.2埃的关闭构象和4.1埃的开放构象的两个结构。

 

通过比较关闭和开放状态的两个结构(如图所示),她们发现位于穿膜区域负责通透离子的通道有明显的变化:在开放构象中,该通道发生扩张,从而使得钙离子能够顺利地从肌质网内部转移到细胞质中。RyR细胞质一侧的可溶区域占据整个蛋白很大的比例,在开放状态下,这部分区域向着肌质网膜靠近,同时还伴随着一定程度的旋转。通过对RyR2中每个相对独立的结构域的仔细比较和分析,她们认为中心结构域(Central domain)极有可能是引发RyR开放的关键,这一发现与之前有关RyR的功能研究结论相吻合。另外,在这篇研究文章中,她们还对部分观察到的结构信息进行了功能方面的验证研究,从而更加全面地展示了RyR2的结构及功能特性。

 

特别值得一提的是,这项研究成果是颜宁研究组在离子通道,特别是兴奋-收缩偶联领域取得的又一重要进展。在此之前,颜宁研究组发表了一系列工作,包括第一个RyR1的高分辨率原子结构以及第一个Cav1.1复合物的高分辨率冷冻电镜结构。她们的后续研究进一步表明,即使在通道保持关闭时,RyR1的胞质区也依然会呈现出不同的动态变化。另外,她们还获得了分辨率为5.7埃的RyR1开放构象结构,并基于结构比对,初步分析了RyR1的门控机理。有关RyR1的这些成果已作为两篇研究论文分别发表在《自然》(Nature)和《细胞研究》(Cell Research)杂志,有关Cav1.1的两篇论文分别发表于《科学》和《自然》杂志。上述研究与最新的这篇《科学》论文极大地促进了我们对于兴奋-收缩偶联的理解。

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原文链接:

http://science.sciencemag.org/content/early/2016/09/23/science.aah5324

RyR1相关文章链接:

http://www.nature.com/nature/journal/v517/n7532/full/nature14063.html

http://www.nature.com/cr/journal/v26/n9/full/cr201689a.html

Cav1.1相关文章链接:

http://science.sciencemag.org/content/350/6267/aad2395.long

http://www.nature.com/nature/journal/v537/n7619/full/nature19321.html